diff --git a/docs/ja/literature.md b/docs/ja/literature.md index bd065b87..02017f81 100644 --- a/docs/ja/literature.md +++ b/docs/ja/literature.md @@ -19,7 +19,7 @@ SELECT (MAX(?dates) as ?date) ?work ?workLabel ?doi WHERE { } GROUP BY ?work ?workLabel ?doi ORDER BY DESC(?date) LIMIT 10 ``` -結果として10件の論文を得ます（全てを取得するには、`LIMIT 10`をクエリから取り除きます）。 +結果として10件の論文を得ます。 @@ -86,7 +86,7 @@ SELECT (MAX(?dates) as ?date) ?work ?workLabel ?doi WHERE { } GROUP BY ?work ?workLabel ?doi ORDER BY DESC(?date) LIMIT 10 ``` -これにより、現在以下の結果を得ます（全てを取得したい場合は`LIMIT 10`を取り除きます）。 +これにより、現在以下の結果を得ます。
diff --git a/docs/ja/solution.md b/docs/ja/solution.md index 91bf70b9..8b86c49e 100644 --- a/docs/ja/solution.md +++ b/docs/ja/solution.md @@ -38,6 +38,35 @@ SELECT ?virus ?virusLabel ?work ?workLabel WITH { ORDER BY ?virusLabel ?workLabel ``` +このクエリの結果は長くなるので、それぞれのウイルスに対する抗体についての論文数を見てみましょう。 + +
+ + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + +
viruscount
SARS関連コロナウイルス (edit)48
MERSコロナウイルス (edit)16
ヒトコロナウイルス229E (edit)2
2019新型コロナウイルス (edit)1
ベータコロナウイルス１ (edit)1
+ なお、抗体は個々のタンパク質に特化しているものであり、そして全てのコロナウイルスは異なるタンパク質を持ちます。 ですから、このクエリ集は単に読むべき関連論文を取得するためのショートカットであり、決してそこから結論を導き出すものではないことを強調しておきます。 @@ -98,226 +127,7 @@ ORDER BY ?virusLabel ?workLabel MERSコロナウイルス (edit) Potent neutralization of MERS-CoV by human neutralizing monoclonal antibodies to the viral spike glycoprotein. (edit) - - MERSコロナウイルス (edit) - Pre- and postexposure efficacy of fully human antibodies against Spike protein in a novel humanized mouse model of MERS-CoV infection (edit) - - - MERSコロナウイルス (edit) - Presence of Middle East respiratory syndrome coronavirus antibodies in Saudi Arabia: a nationwide, cross-sectional, serological study. (edit) - - - MERSコロナウイルス (edit) - Presence of Middle East respiratory syndrome coronavirus antibodies in Saudi Arabia: a nationwide, cross-sectional, serological study. (edit) - - - MERSコロナウイルス (edit) - The receptor binding domain of the new Middle East respiratory syndrome coronavirus maps to a 231-residue region in the spike protein that efficiently elicits neutralizing antibodies. (edit) - - - SARS関連コロナウイルス (edit) - A SARS DNA vaccine induces neutralizing antibody and cellular immune responses in healthy adults in a Phase I clinical trial. (edit) - - - SARS関連コロナウイルス (edit) - A double-inactivated whole virus candidate SARS coronavirus vaccine stimulates neutralising and protective antibody responses. (edit) - - - SARS関連コロナウイルス (edit) - A human SARS-CoV neutralizing antibody against epitope on S2 protein. (edit) - - - SARS関連コロナウイルス (edit) - A single immunization with a rhabdovirus-based vector expressing severe acute respiratory syndrome coronavirus (SARS-CoV) S protein results in the production of high levels of SARS-CoV-neutralizing antibodies (edit) - - - SARS関連コロナウイルス (edit) - Amino acids 15-28 in the ectodomain of SARS coronavirus 3a protein induces neutralizing antibodies. (edit) - - - SARS関連コロナウイルス (edit) - An efficient method to make human monoclonal antibodies from memory B cells: potent neutralization of SARS coronavirus. (edit) - - - SARS関連コロナウイルス (edit) - Antibodies against trimeric S glycoprotein protect hamsters against SARS-CoV challenge despite their capacity to mediate FcgammaRII-dependent entry into B cells in vitro. (edit) - - - SARS関連コロナウイルス (edit) - Antibodies to SARS coronavirus in civets. (edit) - - - SARS関連コロナウイルス (edit) - Antibody response and viraemia during the course of severe acute respiratory syndrome (SARS)-associated coronavirus infection. (edit) - - - SARS関連コロナウイルス (edit) - Antibody response of patients with severe acute respiratory syndrome (SARS) targets the viral nucleocapsid. (edit) - - - SARS関連コロナウイルス (edit) - Antibody responses against SARS coronavirus are correlated with disease outcome of infected individuals. (edit) - - - SARS関連コロナウイルス (edit) - Antibody responses against SARS-coronavirus and its nucleocaspid in SARS patients. (edit) - - - SARS関連コロナウイルス (edit) - Antibody responses to individual proteins of SARS coronavirus and their neutralization activities. (edit) - - - SARS関連コロナウイルス (edit) - Antibody-mediated synergy and interference in the neutralization of SARS-CoV at an epitope cluster on the spike protein. (edit) - - - SARS関連コロナウイルス (edit) - Characterization of monoclonal antibody against SARS coronavirus nucleocapsid antigen and development of an antigen capture ELISA. (edit) - - - SARS関連コロナウイルス (edit) - Characterization of neutralizing monoclonal antibodies recognizing a 15-residues epitope on the spike protein HR2 region of severe acute respiratory syndrome coronavirus (SARS-CoV). (edit) - - - SARS関連コロナウイルス (edit) - Chronological evolution of IgM, IgA, IgG and neutralisation antibodies after infection with SARS-associated coronavirus. (edit) - - - SARS関連コロナウイルス (edit) - Cross-reactive antibodies in convalescent SARS patients' sera against the emerging novel human coronavirus EMC (2012) by both immunofluorescent and neutralizing antibody tests. (edit) - - - SARS関連コロナウイルス (edit) - DNA vaccine of SARS-Cov S gene induces antibody response in mice. (edit) - - - SARS関連コロナウイルス (edit) - Detection of specific antibodies to severe acute respiratory syndrome (SARS) coronavirus nucleocapsid protein for serodiagnosis of SARS coronavirus pneumonia. (edit) - - - SARS関連コロナウイルス (edit) - Development and characterisation of neutralising monoclonal antibody to the SARS-coronavirus. (edit) - - - SARS関連コロナウイルス (edit) - Diagnosis of severe acute respiratory syndrome (SARS) by detection of SARS coronavirus nucleocapsid antibodies in an antigen-capturing enzyme-linked immunosorbent assay (edit) - - - SARS関連コロナウイルス (edit) - Disease-specific B Cell epitopes for serum antibodies from patients with severe acute respiratory syndrome (SARS) and serologic detection of SARS antibodies by epitope-based peptide antigens. (edit) - - - SARS関連コロナウイルス (edit) - Evaluation of a novel vesicular stomatitis virus pseudotype-based assay for detection of neutralizing antibody responses to SARS-CoV. (edit) - - - SARS関連コロナウイルス (edit) - Human monoclonal antibodies against highly conserved HR1 and HR2 domains of the SARS-CoV spike protein are more broadly neutralizing (edit) - - - SARS関連コロナウイルス (edit) - Human monoclonal antibody as prophylaxis for SARS coronavirus infection in ferrets. (edit) - - - SARS関連コロナウイルス (edit) - Human monoclonal antibody combination against SARS coronavirus: synergy and coverage of escape mutants (edit) - - - SARS関連コロナウイルス (edit) - Identification of single-chain antibody fragments specific against SARS-associated coronavirus from phage-displayed antibody library. (edit) - - - SARS関連コロナウイルス (edit) - Inactivated SARS-CoV vaccine elicits high titers of spike protein-specific antibodies that block receptor binding and virus entry. (edit) - - - SARS関連コロナウイルス (edit) - Inactivated SARS-CoV vaccine prepared from whole virus induces a high level of neutralizing antibodies in BALB/c mice. (edit) - - - SARS関連コロナウイルス (edit) - Induction of neutralising antibodies and cellular immune responses against SARS coronavirus by recombinant measles viruses. (edit) - - - SARS関連コロナウイルス (edit) - Label-free, electrical detection of the SARS virus N-protein with nanowire biosensors utilizing antibody mimics as capture probes (edit) - - - SARS関連コロナウイルス (edit) - Long-term persistence of robust antibody and cytotoxic T cell responses in recovered patients infected with SARS coronavirus. (edit) - - - SARS関連コロナウイルス (edit) - Longitudinally profiling neutralizing antibody response to SARS coronavirus with pseudotypes. (edit) - - - SARS関連コロナウイルス (edit) - Monoclonal antibodies to SARS-associated coronavirus (SARS-CoV): identification of neutralizing and antibodies reactive to S, N, M and E viral proteins. (edit) - - - SARS関連コロナウイルス (edit) - Neutralizing antibody and protective immunity to SARS coronavirus infection of mice induced by a soluble recombinant polypeptide containing an N-terminal segment of the spike glycoprotein. (edit) - - - SARS関連コロナウイルス (edit) - Neutralizing antibody response and SARS severity (edit) - - - SARS関連コロナウイルス (edit) - Potent and persistent antibody responses against the receptor-binding domain of SARS-CoV spike protein in recovered patients. (edit) - - - SARS関連コロナウイルス (edit) - Potent cross-reactive neutralization of SARS coronavirus isolates by human monoclonal antibodies. (edit) - - - SARS関連コロナウイルス (edit) - Prevalence of IgG antibody to SARS-associated coronavirus in animal traders--Guangdong Province, China, 2003. (edit) - - - SARS関連コロナウイルス (edit) - Profile of specific antibodies to the SARS-associated coronavirus. (edit) - - - SARS関連コロナウイルス (edit) - Receptor-binding domain of SARS-CoV spike protein induces highly potent neutralizing antibodies: implication for developing subunit vaccine. (edit) - - - SARS関連コロナウイルス (edit) - Recombinant receptor-binding domain of SARS-CoV spike protein expressed in mammalian, insect and E. coli cells elicits potent neutralizing antibody and protective immunity. (edit) - - - SARS関連コロナウイルス (edit) - SARS corona virus peptides recognized by antibodies in the sera of convalescent cases. (edit) - - - SARS関連コロナウイルス (edit) - SARS coronavirus spike polypeptide DNA vaccine priming with recombinant spike polypeptide from Escherichia coli as booster induces high titer of neutralizing antibody against SARS coronavirus. (edit) - - - SARS関連コロナウイルス (edit) - SARS-CoV spike protein-expressing recombinant vaccinia virus efficiently induces neutralizing antibodies in rabbits pre-immunized with vaccinia virus. (edit) - - - SARS関連コロナウイルス (edit) - Sequential affinity purification of peroxidase tagged bispecific anti-SARS-CoV antibodies on phenylboronic acid agarose (edit) - - - SARS関連コロナウイルス (edit) - Template-based coiled-coil antigens elicit neutralizing antibodies to the SARS-coronavirus. (edit) - - - ヒトコロナウイルス229E (edit) - Antibody to virus components in volunteers experimentally infected with human coronavirus 229E group viruses. (edit) - - - ヒトコロナウイルス229E (edit) - Detection of human coronavirus 229E-specific antibodies using recombinant fusion proteins. (edit) - - - ベータコロナウイルス１ (edit) - Development of a recombinant truncated nucleocapsid protein based immunoassay for detection of antibodies against human coronavirus OC43 (edit) - + This table is truncated. See the full table at sparql/antibodies.rq ## 既存薬再開発 @@ -325,7 +135,15 @@ ORDER BY ?virusLabel ?workLabel [3.3](covid.md#sec:trials)章で既に臨床試験の概要を取得しました。 そこでは、どのような症状に人は心配するのかについて知見を得られました。 また、どのような薬が既存薬再開発のために研究されているのか知ることができました。 -大きな注目を浴びる薬もあれば、それほどでもないものもあります。 +大きな注目を浴びる薬もあれば、それほどでもないものもあります。これらは以下のような感じです。 + + 次のクエリにより、介入による臨床試験の事例一覧が得られます。 @@ -403,226 +221,7 @@ SELECT ?intervention ?interventionLabel (COUNT(?trial) AS ?trials) WHERE { メチルプレドニゾロン (edit) 3 - - プレドニゾロン (edit) - 3 - - - methylprednisolone acetate (edit) - 3 - - - 酢酸プレドニゾロン (edit) - 3 - - - methylprednisolone hemisuccinate (edit) - 3 - - - prednisolone 21-phosphate (edit) - 3 - - - prednisolone hemisuccinate (edit) - 3 - - - Siltuximab (edit) - 3 - - - ACE阻害薬 (edit) - 3 - - - アスコルビン酸 (edit) - 3 - - - ニボルマブ (edit) - 3 - - - アジスロマイシン (edit) - 3 - - - coal tar pitch volatiles (edit) - 2 - - - シクロホスファミド (edit) - 2 - - - dexamethasone acetate (edit) - 2 - - - BCG (edit) - 2 - - - Sargramostim (edit) - 2 - - - gloriosine (edit) - 2 - - - Janus kinase inhibitor (edit) - 2 - - - アボネックス (edit) - 2 - - - アナキンラ (edit) - 2 - - - テノフォビル (edit) - 2 - - - エムトリシタビン (edit) - 2 - - - ルキソリチニブ (edit) - 2 - - - サリドマイド (edit) - 2 - - - ベバシズマブ (edit) - 2 - - - レムデシビル (edit) - 2 - - - mRNA-1273 (edit) - 2 - - - ブデソニド (edit) - 2 - - - ナプロキセン (edit) - 1 - - - 免疫抑制剤 (edit) - 1 - - - AZD1222 (edit) - 1 - - - 非ステロイド性抗炎症薬 (edit) - 1 - - - gabexate (edit) - 1 - - - thymalfasin (edit) - 1 - - - Angiotensin II (edit) - 1 - - - シクレソニド (edit) - 1 - - - (5R)-24,25-Dihydroxyvitamin D (edit) - 1 - - - Ergocalciferols (edit) - 1 - - - デフェロキサミン (edit) - 1 - - - piclidenoson (edit) - 1 - - - ブロムヘキシン (edit) - 1 - - - neonate (edit) - 1 - - - fingolimod hydrochloride (edit) - 1 - - - 免疫グロブリン (edit) - 1 - - - クエン酸 (edit) - 1 - - - クエン酸ナトリウム (edit) - 1 - - - sildenafil citrate (edit) - 1 - - - オセルタミビル (edit) - 1 - - - ダルナビル (edit) - 1 - - - フェントラミン (edit) - 1 - - - ロピナビル・リトナビル (edit) - 1 - - - Xuebijing (edit) - 1 - - - アトルバスタチン (edit) - 1 - - - レバミゾール (edit) - 1 - - - formoterol fumarate (edit) - 1 - + This table is truncated. See the full table at sparql/clinicalTrialsByIntervention.rq 重要なことは、どのような介入がより多くの注目を集めているかを把握できるに過ぎない、ということです。