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shinyServer(function(session, input, output) {
# READ DATA ----
baseData <- reactiveValues(spdf = NULL, df = NULL)
observe({
req(input$fileInput)
if(input$sepdec == "." & input$encodtab == "UTF-8"){
inputLocale <- locale("fr", encoding = "UTF-8", decimal_mark = ".")
} else if(input$sepdec == "," & input$encodtab == "UTF-8") {
inputLocale <- locale("fr", encoding = "UTF-8", decimal_mark = ",")
} else if(input$sepdec == "." & input$encodtab == "latin1") {
inputLocale <- locale("fr", encoding = "latin1", decimal_mark = ".")
} else if(input$sepdec == "," & input$encodtab == "latin1") {
inputLocale <- locale("fr", encoding = "latin1", decimal_mark = ",")
}
baseData$df <- as.data.frame(read_delim(file = input$fileInput$datapath,
delim = input$sepcol,
quote = input$quote,
locale = inputLocale))
})
observe({
req(input$shapeInput)
oriDir <- getwd()
setwd(tempdir())
unzip(zipfile = input$shapeInput$datapath, overwrite = TRUE, exdir = "shpdir")
fileName <- list.files("shpdir")[1]
layerName <- substr(fileName, start = 1, stop = nchar(fileName) - 4)
spObject <- readOGR(dsn = "shpdir", layer = layerName, stringsAsFactors = FALSE)
setwd(oriDir)
baseData$spdf <- spObject
})
observe({
req(baseData$df)
columnList <- colnames(baseData$df)
updateSelectInput(session = session,
inputId = "vartot",
choices = columnList)
updateSelectInput(session = session,
inputId = "varuni",
choices = columnList)
updateSelectInput(session = session,
inputId = "varqualiquali",
choices = columnList)
updateSelectInput(session = session,
inputId = "varquantiquanti",
choices = columnList)
updateSelectInput(session = session,
inputId = "varqualiquanti",
choices = columnList)
updateSelectInput(session = session,
inputId = "varregress2",
choices = columnList)
updateSelectInput(session = session,
inputId = "varanova2",
choices = columnList)
updateSelectInput(session = session,
inputId = "varancova",
choices = columnList)
updateSelectInput(session = session,
inputId = "varacp",
choices = columnList)
updateSelectInput(session = session,
inputId = "varacpid",
choices = columnList)
updateSelectInput(session = session,
inputId = "varcah",
choices = columnList)
updateSelectInput(session = session,
inputId = "varcarto1",
choices = c("ø", columnList))
updateSelectInput(session = session,
inputId = "varcarto2",
choices = c("ø", columnList))
updateSelectInput(session = session,
inputId = "idtab",
choices = c("ø", columnList))
})
observe({
req(baseData$spdf)
columnListShape <- colnames(as.data.frame(baseData$spdf))
updateSelectInput(session = session,
inputId = "idshape",
choices = c("ø", columnListShape))
})
# OUTPUTS ----
# Guide
output$citation <- renderText("
<strong>1. Charger les données</strong> <br/>
<ul>
<li>Le tableau est requis, il doit être au format CSV avec les bons paramètres (séparateurs).</li>
<li>Le fond de carte est optionnel, il doit être au format Esri Shape dans un dossier zippé (ZIP).</li>
<li>L'identifiant est requis pour la jointure entre les deux fichiers mais aussi quand un tableau seul est fourni.</li>
</ul>
<strong>2. Décrire le sujet et les données</strong> <br/>
<ul>
<li>Cette étape est optionnelle.</li>
<li>Par défaut ce sont les intitulés de colonne du tableau qui sont utilisés dans les sorties numériques et graphiques.</li>
</ul>
<strong>3. Choisir les analyses à effecture</strong> <br/>
<ul>
<li>Les analyses bi- et tri-variées correspondent à des modèles de régression linéaire avec ajustement des moindres carrés.</li>
<li>L'analyse en composantes principales est calculée sur des variables automatiquement standardisées (ACP normée).</li>
<li>La classification est une classification ascendante hiérarchique avec distance euclidienne et critère de Ward sur variables standardisées.</li>
<li>La cartographie peut être effectuée sur des variables initiales ou sur des résultats d'analyse.
Sur les résultats d'analyses la discrétisation se fait par défaut selon moyenne et écart-type.</li>
<li>Les statistiques de test affichent les valeurs seuils de trois lois (F, T, Chi2) avec les probabilités et les degrés de liberté choisis.</li>
</ul>
<strong>4. Télécharger le document au format voulu</strong> <br/>
<ul>
<li>Choisir le format (PDF, ODT, DOCX) et télécharger.</li>
</ul>
")
# Report
output$report <- downloadHandler(
filename = function() {paste("exam.", sep = "", switch(input$docformat, pdf = "pdf", odt = "odt", docx = "docx"))},
content = function(file){
if(input$docformat == "pdf"){
knit2pdf("exam.Rnw", compiler = "pdflatex")
file.copy("exam.pdf", file)
file.remove("exam.pdf", "exam.tex",
"exam.aux", "exam.log")
unlink("figure", recursive = TRUE)
} else if (input$docformat == "odt"){
knit2pdf("exam.Rnw", compiler = "pdflatex")
setwd("figure/")
file.rename(from = list.files(), to = sapply(list.files(), FUN = function(x) substr(x = x, start = 1, stop = nchar(x) - 4)))
setwd("..")
pandoc(input = "exam.tex", format = "odt")
file.copy("exam_utf8.odt", file)
file.remove("exam_utf8.odt",
"exam.pdf", "exam.tex",
"exam.aux", "exam.log")
unlink("figure", recursive = TRUE)
} else if (input$docformat == "docx"){
knit2pdf("exam.Rnw", compiler = "pdflatex")
setwd("figure/")
file.rename(from = list.files(), to = sapply(list.files(), FUN = function(x) substr(x = x, start = 1, stop = nchar(x) - 4)))
setwd("..")
pandoc(input = "exam.tex", format = "docx")
file.copy("exam_utf8.docx", file)
file.remove("exam_utf8.docx",
"exam.pdf", "exam.tex",
"exam.aux", "exam.log")
unlink("figure", recursive = TRUE)
}
}
)
})