maak een functie phyloseq_to_metabar

[hansvancalster]

          > De bedoeling is onderstaande figuur maken, om een overzicht te krijgen van de gedetecteerde taxa

Het probleem is dat dit enkel kan gemaakt worden met het metabaR package, en phyloseq data in de juiste format krijgen voor metabaR is inderdaad omslachtig, bij mijn weten is er geen phyloseq to metabar functie zoals voor vegan of tidytacos. Dit is hoe we het momenteel doen, en ik dacht dit ook in deze github te documenteren...

Olig01_Annelida_mbag_metabaR.pdf

Het is in elk geval een goed idee om dit te documenteren en ik ben nu mee met de finaliteit. Maar het zou veel properder zijn als dit script wordt omgevormd naar een R functie phyloseq_to_metabarlist of iets dergelijks. Waarna we deze functie kunnen aanroepen in Rmarkdown bestand en daar gebruiken.

Originally posted by @hansvancalster in #11 (comment)

[slambrechts]

see also https://github.com/slambrechts/INBO_eDNA_metabarcoding_BODEM/issues/230