-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 0
/
Copy pathobcs.obo
747 lines (563 loc) · 9.31 KB
/
obcs.obo
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
390
391
392
393
394
395
396
397
398
399
400
401
402
403
404
405
406
407
408
409
410
411
412
413
414
415
416
417
418
419
420
421
422
423
424
425
426
427
428
429
430
431
432
433
434
435
436
437
438
439
440
441
442
443
444
445
446
447
448
449
450
451
452
453
454
455
456
457
458
459
460
461
462
463
464
465
466
467
468
469
470
471
472
473
474
475
476
477
478
479
480
481
482
483
484
485
486
487
488
489
490
491
492
493
494
495
496
497
498
499
500
501
502
503
504
505
506
507
508
509
510
511
512
513
514
515
516
517
518
519
520
521
522
523
524
525
526
527
528
529
530
531
532
533
534
535
536
537
538
539
540
541
542
543
544
545
546
547
548
549
550
551
552
553
554
555
556
557
558
559
560
561
562
563
564
565
566
567
568
569
570
571
572
573
574
575
576
577
578
579
580
581
582
583
584
585
586
587
588
589
590
591
592
593
594
595
596
597
598
599
600
601
602
603
604
605
606
607
608
609
610
611
612
613
614
615
616
617
618
619
620
621
622
623
624
625
626
627
628
629
630
631
632
633
634
635
636
637
638
639
640
641
642
643
644
645
646
647
648
649
650
651
652
653
654
655
656
657
658
659
660
661
662
663
664
665
666
667
668
669
670
671
672
673
674
675
676
677
678
679
680
681
682
683
684
685
686
687
688
689
690
691
692
693
694
695
696
697
698
699
700
701
702
703
704
705
706
707
708
709
710
711
712
713
714
715
716
717
718
719
720
721
722
723
724
725
726
727
728
729
730
731
732
733
734
735
736
737
738
739
740
741
742
743
744
745
746
format-version: 1.2
data-version: releases/2018-12-03
remark: Ontology for Biological and Clinical Statistics
import: http://purl.obolibrary.org/obo/obcs/imports/obi_import.owl
import: http://purl.obolibrary.org/obo/obcs/imports/pato_import.owl
import: http://purl.obolibrary.org/obo/obcs/imports/ro_import.owl
import: http://purl.obolibrary.org/obo/obcs/imports/stato_import.owl
ontology: obcs
owl-axioms: Prefix(owl:=<http://www.w3.org/2002/07/owl#>)\nPrefix(rdf:=<http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#>)\nPrefix(xml:=<http://www.w3.org/XML/1998/namespace>)\nPrefix(xsd:=<http://www.w3.org/2001/XMLSchema#>)\nPrefix(rdfs:=<http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#>)\n\n\nOntology(\nDeclaration(Class(<http://purl.obolibrary.org/obo/BFO_0000001>))\nDeclaration(Class(<http://purl.obolibrary.org/obo/GO_0004872>))\nDeclaration(Class(<http://purl.obolibrary.org/obo/GO_0048018>))\nDeclaration(Class(<http://purl.obolibrary.org/obo/OBCS_00000000>))\n############################\n# Classes\n############################\n\n# Class: <http://purl.obolibrary.org/obo/BFO_0000001> (entity)\n\nSubClassOf(<http://purl.obolibrary.org/obo/BFO_0000001> owl:Thing)\n\n# Class: <http://purl.obolibrary.org/obo/GO_0004872> (<http://purl.obolibrary.org/obo/GO_0004872>)\n\nSubClassOf(<http://purl.obolibrary.org/obo/GO_0004872> owl:Thing)\n\n# Class: <http://purl.obolibrary.org/obo/GO_0048018> (<http://purl.obolibrary.org/obo/GO_0048018>)\n\nSubClassOf(<http://purl.obolibrary.org/obo/GO_0048018> owl:Thing)\n\n# Class: <http://purl.obolibrary.org/obo/OBCS_00000000> (obcs)\n\nSubClassOf(<http://purl.obolibrary.org/obo/OBCS_00000000> owl:Thing)\n\n\n)
[Term]
id: BFO:0000002
is_a: BFO:0000001
[Term]
id: BFO:0000003
is_a: BFO:0000001
[Term]
id: BFO:0000004
is_a: BFO:0000002
[Term]
id: BFO:0000015
is_a: BFO:0000003
[Term]
id: BFO:0000017
is_a: BFO:0000020
[Term]
id: BFO:0000019
is_a: BFO:0000020
[Term]
id: BFO:0000020
is_a: BFO:0000002
[Term]
id: BFO:0000023
is_a: BFO:0000017
[Term]
id: BFO:0000031
is_a: BFO:0000002
[Term]
id: BFO:0000040
is_a: BFO:0000004
[Term]
id: CARO:0000000
is_a: CARO:0030000
[Term]
id: CARO:0000003
is_a: CARO:0000006
[Term]
id: CARO:0000006
is_a: BFO:0000040
is_a: CARO:0000000
[Term]
id: CARO:0030000
is_a: BFO:0000004
[Term]
id: CL:0000000
is_a: CARO:0000003
[Term]
id: CL:0000540
is_a: CL:0000000
[Term]
id: GO:0003674
is_a: BFO:0000015
[Term]
id: GO:0003824
is_a: GO:0003674
[Term]
id: GO:0008150
is_a: BFO:0000015
[Term]
id: GO:0016301
is_a: GO:0016772
[Term]
id: GO:0016740
is_a: GO:0003824
[Term]
id: GO:0016772
is_a: GO:0016740
[Term]
id: IAO:0000003
is_a: IAO:0000009
[Term]
id: IAO:0000005
is_a: IAO:0000033
[Term]
id: IAO:0000007
is_a: IAO:0000033
[Term]
id: IAO:0000009
is_a: IAO:0000030
[Term]
id: IAO:0000010
is_a: IAO:0000104
[Term]
id: IAO:0000015
is_a: BFO:0000019
[Term]
id: IAO:0000027
is_a: IAO:0000030
[Term]
id: IAO:0000030
is_a: BFO:0000031
[Term]
id: IAO:0000032
is_a: IAO:0000109
[Term]
id: IAO:0000033
is_a: IAO:0000030
[Term]
id: IAO:0000037
is_a: IAO:0000038
[Term]
id: IAO:0000038
is_a: IAO:0000309
[Term]
id: IAO:0000064
is_a: IAO:0000104
[Term]
id: IAO:0000078
is_a: IAO:0000102
[Term]
id: IAO:0000098
is_a: IAO:0000033
[Term]
id: IAO:0000100
is_a: IAO:0000027
[Term]
id: IAO:0000101
is_a: IAO:0000308
[Term]
id: IAO:0000102
is_a: IAO:0000027
[Term]
id: IAO:0000104
is_a: IAO:0000033
[Term]
id: IAO:0000109
is_a: IAO:0000027
[Term]
id: IAO:0000178
is_a: BFO:0000040
[Term]
id: IAO:0000179
is_a: IAO:0000038
[Term]
id: IAO:0000180
is_a: IAO:0000038
[Term]
id: IAO:0000183
is_a: IAO:0000038
[Term]
id: IAO:0000184
is_a: IAO:0000038
[Term]
id: IAO:0000225
is_a: IAO:0000102
[Term]
id: IAO:0000308
is_a: IAO:0000030
[Term]
id: IAO:0000309
is_a: IAO:0000308
[Term]
id: IAO:0000310
is_a: IAO:0000030
[Term]
id: IAO:0000409
is_a: IAO:0000102
[Term]
id: IAO:0000572
is_a: OBI:0000011
[Term]
id: NCBITaxon:10239
is_a: OBI:0100026
[Term]
id: NCBITaxon:117571
is_a: NCBITaxon:7742
[Term]
id: NCBITaxon:2
is_a: OBI:0100026
[Term]
id: NCBITaxon:2157
is_a: OBI:0100026
[Term]
id: NCBITaxon:2759
is_a: OBI:0100026
[Term]
id: NCBITaxon:314146
is_a: NCBITaxon:40674
[Term]
id: NCBITaxon:32523
is_a: NCBITaxon:117571
[Term]
id: NCBITaxon:32524
is_a: NCBITaxon:32523
[Term]
id: NCBITaxon:33154
is_a: NCBITaxon:2759
[Term]
id: NCBITaxon:33213
is_a: NCBITaxon:33154
[Term]
id: NCBITaxon:40674
is_a: NCBITaxon:32524
[Term]
id: NCBITaxon:7742
is_a: NCBITaxon:33213
[Term]
id: NCBITaxon:9606
is_a: NCBITaxon:314146
[Term]
id: OBCS:00000000
name: obcs
[Term]
id: OBI:0000011
is_a: BFO:0000015
[Term]
id: OBI:0000014
is_a: OBI:0000017
[Term]
id: OBI:0000017
is_a: BFO:0000023
[Term]
id: OBI:0000018
is_a: OBI:0000947
[Term]
id: OBI:0000023
is_a: IAO:0000100
[Term]
id: OBI:0000047
is_a: BFO:0000040
[Term]
id: OBI:0000066
is_a: OBI:0000011
[Term]
id: OBI:0000094
is_a: OBI:0000011
[Term]
id: OBI:0000112
is_a: BFO:0000023
[Term]
id: OBI:0000181
is_a: BFO:0000040
[Term]
id: OBI:0000245
is_a: BFO:0000040
[Term]
id: OBI:0000272
is_a: IAO:0000104
[Term]
id: OBI:0000338
is_a: OBI:0000011
[Term]
id: OBI:0000339
is_a: BFO:0000015
[Term]
id: OBI:0000450
is_a: OBI:0000245
[Term]
id: OBI:0000456
is_a: IAO:0000005
[Term]
id: OBI:0000457
is_a: OBI:0000094
[Term]
id: OBI:0000458
is_a: OBI:0000456
[Term]
id: OBI:0000471
is_a: OBI:0000011
[Term]
id: OBI:0000571
is_a: BFO:0000023
[Term]
id: OBI:0000648
is_a: IAO:0000100
[Term]
id: OBI:0000659
is_a: OBI:0000011
[Term]
id: OBI:0000663
is_a: OBI:0200000
[Term]
id: OBI:0000684
is_a: IAO:0000005
[Term]
id: OBI:0000700
is_a: OBI:0000663
[Term]
id: OBI:0000704
is_a: OBI:0200166
[Term]
id: OBI:0000707
is_a: OBI:0200000
[Term]
id: OBI:0000713
is_a: IAO:0000010
[Term]
id: OBI:0000726
is_a: OBI:0200000
[Term]
id: OBI:0000727
is_a: OBI:0200171
is_a: OBI:0200175
[Term]
id: OBI:0000749
is_a: OBI:0000707
[Term]
id: OBI:0000750
is_a: STATO:0000258
[Term]
id: OBI:0000751
is_a: STATO:0000258
[Term]
id: OBI:0000792
is_a: OBI:0200171
[Term]
id: OBI:0000835
is_a: BFO:0000040
[Term]
id: OBI:0000938
is_a: IAO:0000109
[Term]
id: OBI:0000947
is_a: BFO:0000023
[Term]
id: OBI:0000953
is_a: OBI:0000047
is_a: OBI:0100051
[Term]
id: OBI:0000963
is_a: IAO:0000009
[Term]
id: OBI:0001000
is_a: IAO:0000310
[Term]
id: OBI:0001909
is_a: IAO:0000030
[Term]
id: OBI:0001930
is_a: OBI:0001933
[Term]
id: OBI:0001931
is_a: OBI:0001933
[Term]
id: OBI:0001933
is_a: IAO:0000030
[Term]
id: OBI:0002076
is_a: BFO:0000040
[Term]
id: OBI:0002205
is_a: OBI:0001930
[Term]
id: OBI:0002210
is_a: OBI:0001930
[Term]
id: OBI:0002215
is_a: OBI:0001930
[Term]
id: OBI:0002216
is_a: OBI:0002215
[Term]
id: OBI:0002219
is_a: OBI:0002215
[Term]
id: OBI:0002224
is_a: OBI:0001930
[Term]
id: OBI:0002232
is_a: OBI:0001930
[Term]
id: OBI:0002243
is_a: OBI:0001930
[Term]
id: OBI:0002256
is_a: OBI:0001930
[Term]
id: OBI:0002270
is_a: OBI:0001930
[Term]
id: OBI:0002279
is_a: OBI:0001930
[Term]
id: OBI:0002284
is_a: OBI:0001930
[Term]
id: OBI:0002287
is_a: OBI:0001930
[Term]
id: OBI:0002290
is_a: OBI:0001930
[Term]
id: OBI:0002298
is_a: OBI:0001930
[Term]
id: OBI:0002306
is_a: OBI:0001930
[Term]
id: OBI:0002310
is_a: OBI:0001930
[Term]
id: OBI:0002314
is_a: OBI:0001930
[Term]
id: OBI:0002326
is_a: OBI:0001930
[Term]
id: OBI:0002341
is_a: OBI:0001930
[Term]
id: OBI:0002356
is_a: OBI:0001930
[Term]
id: OBI:0002357
is_a: OBI:0002356
[Term]
id: OBI:0002363
is_a: OBI:0002356
[Term]
id: OBI:0100026
is_a: BFO:0000040
[Term]
id: OBI:0100051
is_a: BFO:0000040
[Term]
id: OBI:0200000
is_a: OBI:0000011
[Term]
id: OBI:0200033
is_a: OBI:0000792
[Term]
id: OBI:0200041
is_a: OBI:0200171
is_a: OBI:0200175
[Term]
id: OBI:0200042
is_a: OBI:0200175
[Term]
id: OBI:0200050
is_a: OBI:0200175
[Term]
id: OBI:0200051
is_a: OBI:0200050
[Term]
id: OBI:0200111
is_a: OBI:0000011
[Term]
id: OBI:0200166
is_a: IAO:0000005
[Term]
id: OBI:0200171
is_a: OBI:0200000
[Term]
id: OBI:0200172
is_a: OBI:0200166
[Term]
id: OBI:0200175
is_a: OBI:0200000
[Term]
id: OBI:0200178
is_a: OBI:0200166
[Term]
id: OBI:0200179
is_a: OBI:0200166
[Term]
id: OBI:0200188
is_a: OBI:0200172
[Term]
id: OBI:0200190
is_a: OBI:0200111
[Term]
id: OBI:0500000
is_a: IAO:0000104
[Term]
id: OBI:0500006
is_a: OBI:0500000
[Term]
id: PATO:0000001
is_a: BFO:0000020
[Term]
id: PATO:0000068
is_a: PATO:0000001
[Term]
id: PATO:0000069
is_a: PATO:0000068
[Term]
id: PATO:0000186
is_a: PATO:0001237
[Term]
id: PATO:0000460
is_a: PATO:0000069
[Term]
id: PATO:0001237
is_a: BFO:0000019
[Term]
id: PATO:0002201
is_a: PATO:0000186
[Term]
id: PATO:0002202
is_a: PATO:0002201
[Term]
id: PATO:0002203
is_a: PATO:0002201
[Term]
id: PATO:0002204
is_a: PATO:0002201
[Term]
id: STATO:0000005
is_a: OBI:0500000
[Term]
id: STATO:0000087
is_a: STATO:0000252
[Term]
id: STATO:0000193
is_a: OBI:0000181
[Term]
id: STATO:0000251
is_a: STATO:0000258
[Term]
id: STATO:0000252
is_a: STATO:0000258
[Term]
id: STATO:0000258
is_a: IAO:0000027
is_a: IAO:0000033
[Term]
id: Subset
is_a: IAO:0000102
[Term]
id: UBERON:0000465
is_a: BFO:0000040
[Term]
id: UBERON:0002048
is_a: UBERON:0000465
[Term]
id: UO:0000001
is_a: IAO:0000003
[Term]
id: UO:0000002
is_a: IAO:0000003
[Term]
id: UO:0000003
is_a: IAO:0000003
[Term]
id: UO:0000005
is_a: IAO:0000003
[Term]
id: UO:0000006
is_a: IAO:0000003
[Term]
id: UO:0000051
is_a: IAO:0000003
[Term]
id: UO:0000095
is_a: IAO:0000003
[Term]
id: UO:0000105
is_a: IAO:0000003
[Term]
id: UO:0000270
is_a: IAO:0000003
[Term]
id: UO:0000280
is_a: IAO:0000003