Lire les référentiels et accéder à des listes de requêtes pour le PMSI avec python
pip install https://github.com/GuillaumePressiat/refpymsi/releases/download/2024.0.1/refpymsi-2024.0.1-py3-none-any.whl
# Exemples
import refpymsi as rp
[rp.get_table('ccam_actes'),
rp.get_table('orpha'),
rp.get_table('tarifs_mco_ghs')
]
[shape: (8_542, 7)
┌─────────┬─────────────────┬───────────┬─────────────────┬────────────┬────────────────┬──────────┐
│ code ┆ libelle_court ┆ type_acte ┆ compatibilite_s ┆ date_debut ┆ libelle_long ┆ date_fin │
│ --- ┆ --- ┆ --- ┆ exe ┆ --- ┆ --- ┆ --- │
│ str ┆ str ┆ str ┆ --- ┆ str ┆ str ┆ str │
│ ┆ ┆ ┆ str ┆ ┆ ┆ │
╞═════════╪═════════════════╪═══════════╪═════════════════╪════════════╪════════════════╪══════════╡
│ AAFA001 ┆ exérèse T. ┆ 0 ┆ 0 ┆ 2005-03-01 ┆ Exérèse de ┆ null │
│ ┆ intraparench ┆ ┆ ┆ ┆ tumeur intrapa ┆ │
│ ┆ cervelet… ┆ ┆ ┆ ┆ renchym… ┆ │
│ AAFA002 ┆ exérèse T. ┆ 0 ┆ 0 ┆ 2005-03-01 ┆ Exérèse de ┆ null │
│ ┆ intraparench ┆ ┆ ┆ ┆ tumeur intrapa ┆ │
│ ┆ cerveau … ┆ ┆ ┆ ┆ renchym… ┆ │
│ AAFA003 ┆ exérèse lés. ┆ 0 ┆ 0 ┆ 2005-03-01 ┆ Exérèse de ┆ null │
│ ┆ tr. céréb. ┆ ┆ ┆ ┆ lésion du ┆ │
│ ┆ craniot. ┆ ┆ ┆ ┆ tronc céréb… ┆ │
│ AAFA004 ┆ hémisphérectomi ┆ 0 ┆ 0 ┆ 2005-03-01 ┆ Hémisphérectom ┆ null │
│ ┆ e fct craniot. ┆ ┆ ┆ ┆ ie ┆ │
│ ┆ ┆ ┆ ┆ ┆ fonctionnelle, ┆ │
│ ┆ ┆ ┆ ┆ ┆ … ┆ │
│ … ┆ … ┆ … ┆ … ┆ … ┆ … ┆ … │
│ ZZQX200 ┆ EXAM HISTOPATH ┆ 0 ┆ 0 ┆ 2014-04-14 ┆ Examen histopa ┆ null │
│ ┆ BIOPSIES ÉTAGÉS ┆ ┆ ┆ ┆ thologique de ┆ │
│ ┆ 2… ┆ ┆ ┆ ┆ biop… ┆ │
│ ZZQX217 ┆ EXAM HISTOPATH ┆ 0 ┆ 0 ┆ 2014-04-14 ┆ Examen histopa ┆ null │
│ ┆ BIOPSIES 1 ┆ ┆ ┆ ┆ thologique de ┆ │
│ ┆ STRUCT… ┆ ┆ ┆ ┆ biop… ┆ │
│ ZZQX603 ┆ TEST DETECT ┆ 0 ┆ 0 ┆ 2020-02-18 ┆ Test de ┆ null │
│ ┆ GENOME ┆ ┆ ┆ ┆ détection du ┆ │
│ ┆ PAPILLOMAVIRU… ┆ ┆ ┆ ┆ génome des … ┆ │
│ ZZQX628 ┆ TEST DETECT ┆ 0 ┆ 0 ┆ 2020-02-18 ┆ Test de ┆ null │
│ ┆ GENOME ┆ ┆ ┆ ┆ détection du ┆ │
│ ┆ PAPILLOMAVIRU… ┆ ┆ ┆ ┆ génome des … ┆ │
└─────────┴─────────────────┴───────────┴─────────────────┴────────────┴────────────────┴──────────┘,
shape: (9_546, 12)
┌───────┬────────────┬────────────┬────────────┬───┬────────────┬───────────┬───────────┬──────────┐
│ id ┆ orphanumbe ┆ expertlink ┆ name ┆ … ┆ omim ┆ umls ┆ mesh ┆ meddra │
│ --- ┆ r ┆ --- ┆ --- ┆ ┆ --- ┆ --- ┆ --- ┆ --- │
│ str ┆ --- ┆ str ┆ str ┆ ┆ str ┆ str ┆ str ┆ str │
│ ┆ str ┆ ┆ ┆ ┆ ┆ ┆ ┆ │
╞═══════╪════════════╪════════════╪════════════╪═══╪════════════╪═══════════╪═══════════╪══════════╡
│ 3555 ┆ 5 ┆ http://www ┆ Déficit en ┆ … ┆ 609016 ┆ C0342786 ┆ null ┆ null │
│ ┆ ┆ .orpha.net ┆ 3-hydroxya ┆ ┆ ┆ ; ┆ ┆ │
│ ┆ ┆ /consor/cg ┆ cyl-CoA ┆ ┆ ┆ C1969443 ┆ ┆ │
│ ┆ ┆ i-… ┆ dés… ┆ ┆ ┆ ┆ ┆ │
│ 3297 ┆ 6 ┆ http://www ┆ Déficit en ┆ … ┆ 210200 ; ┆ C0268600 ┆ C535308 ┆ null │
│ ┆ ┆ .orpha.net ┆ 3-méthylcr ┆ ┆ 210210 ┆ ┆ ┆ │
│ ┆ ┆ /consor/cg ┆ otonyl-CoA ┆ ┆ ┆ ┆ ┆ │
│ ┆ ┆ i-… ┆ … ┆ ┆ ┆ ┆ ┆ │
│ 1242 ┆ 7 ┆ http://www ┆ Syndrome ┆ … ┆ 220210 ; ┆ C0796137 ┆ C535313 ┆ null │
│ ┆ ┆ .orpha.net ┆ 3C ┆ ┆ 300963 ┆ ┆ ┆ │
│ ┆ ┆ /consor/cg ┆ ┆ ┆ ┆ ┆ ┆ │
│ ┆ ┆ i-… ┆ ┆ ┆ ┆ ┆ ┆ │
│ 335 ┆ 8 ┆ http://www ┆ Syndrome ┆ … ┆ null ┆ C3266843 ┆ C535317 ; ┆ 10056894 │
│ ┆ ┆ .orpha.net ┆ 47,XYY ┆ ┆ ┆ ; ┆ D014997 ┆ │
│ ┆ ┆ /consor/cg ┆ ┆ ┆ ┆ C0043379 ┆ ┆ │
│ ┆ ┆ i-… ┆ ┆ ┆ ┆ ┆ ┆ │
│ … ┆ … ┆ … ┆ … ┆ … ┆ … ┆ … ┆ … ┆ … │
│ 26574 ┆ 508523 ┆ http://www ┆ Hyperphény ┆ … ┆ null ┆ null ┆ null ┆ null │
│ ┆ ┆ .orpha.net ┆ lalaninémi ┆ ┆ ┆ ┆ ┆ │
│ ┆ ┆ /consor/cg ┆ e due à un ┆ ┆ ┆ ┆ ┆ │
│ ┆ ┆ i-… ┆ d… ┆ ┆ ┆ ┆ ┆ │
│ 26575 ┆ 508529 ┆ http://www ┆ Epidermoly ┆ … ┆ null ┆ null ┆ null ┆ null │
│ ┆ ┆ .orpha.net ┆ se ┆ ┆ ┆ ┆ ┆ │
│ ┆ ┆ /consor/cg ┆ bulleuse ┆ ┆ ┆ ┆ ┆ │
│ ┆ ┆ i-… ┆ simple ┆ ┆ ┆ ┆ ┆ │
│ ┆ ┆ ┆ bas… ┆ ┆ ┆ ┆ ┆ │
│ 26576 ┆ 508533 ┆ http://www ┆ Syndrome ┆ … ┆ null ┆ null ┆ null ┆ null │
│ ┆ ┆ .orpha.net ┆ de ┆ ┆ ┆ ┆ ┆ │
│ ┆ ┆ /consor/cg ┆ dysplasie ┆ ┆ ┆ ┆ ┆ │
│ ┆ ┆ i-… ┆ squelettiq ┆ ┆ ┆ ┆ ┆ │
│ ┆ ┆ ┆ … ┆ ┆ ┆ ┆ ┆ │
│ 26578 ┆ 508542 ┆ http://www ┆ Syndrome ┆ … ┆ null ┆ null ┆ null ┆ null │
│ ┆ ┆ .orpha.net ┆ de pancyto ┆ ┆ ┆ ┆ ┆ │
│ ┆ ┆ /consor/cg ┆ pénie ┆ ┆ ┆ ┆ ┆ │
│ ┆ ┆ i-… ┆ progres… ┆ ┆ ┆ ┆ ┆ │
└───────┴────────────┴────────────┴────────────┴───┴────────────┴───────────┴───────────┴──────────┘,
shape: (44_055, 12)
┌──────┬────────┬────────────────────┬─────────────┬───┬───────────┬────────────┬─────────┬────────┐
│ ghs ┆ ghm ┆ libelle_ghm ┆ borne_basse ┆ … ┆ tarif_exh ┆ date_effet ┆ anseqta ┆ time_i │
│ --- ┆ --- ┆ --- ┆ --- ┆ ┆ --- ┆ --- ┆ --- ┆ --- │
│ str ┆ str ┆ str ┆ i64 ┆ ┆ f64 ┆ str ┆ str ┆ str │
╞══════╪════════╪════════════════════╪═════════════╪═══╪═══════════╪════════════╪═════════╪════════╡
│ 0022 ┆ 01C031 ┆ Craniotomies pour ┆ 4 ┆ … ┆ 116.2 ┆ 01/03/2010 ┆ 2010 ┆ 2010 │
│ ┆ ┆ traumatisme, â… ┆ ┆ ┆ ┆ ┆ ┆ │
│ 0023 ┆ 01C032 ┆ Craniotomies pour ┆ 7 ┆ … ┆ 87.53 ┆ 01/03/2010 ┆ 2010 ┆ 2010 │
│ ┆ ┆ traumatisme, â… ┆ ┆ ┆ ┆ ┆ ┆ │
│ 0024 ┆ 01C033 ┆ Craniotomies pour ┆ 7 ┆ … ┆ 69.99 ┆ 01/03/2010 ┆ 2010 ┆ 2010 │
│ ┆ ┆ traumatisme, â… ┆ ┆ ┆ ┆ ┆ ┆ │
│ 0025 ┆ 01C034 ┆ Craniotomies pour ┆ 12 ┆ … ┆ 241.16 ┆ 01/03/2010 ┆ 2010 ┆ 2010 │
│ ┆ ┆ traumatisme, â… ┆ ┆ ┆ ┆ ┆ ┆ │
│ … ┆ … ┆ … ┆ … ┆ … ┆ … ┆ … ┆ … ┆ … │
│ 9631 ┆ 28Z23Z ┆ Techniques ┆ 0 ┆ … ┆ 0.0 ┆ 01/03/2023 ┆ 2023 ┆ 2023 │
│ ┆ ┆ complexes ┆ ┆ ┆ ┆ ┆ ┆ │
│ ┆ ┆ d'irradiati… ┆ ┆ ┆ ┆ ┆ ┆ │
│ 9632 ┆ 28Z24Z ┆ Techniques ┆ 0 ┆ … ┆ 0.0 ┆ 01/03/2023 ┆ 2023 ┆ 2023 │
│ ┆ ┆ complexes ┆ ┆ ┆ ┆ ┆ ┆ │
│ ┆ ┆ d'irradiati… ┆ ┆ ┆ ┆ ┆ ┆ │
│ 9633 ┆ 28Z25Z ┆ Autres techniques ┆ 0 ┆ … ┆ 0.0 ┆ 01/03/2023 ┆ 2023 ┆ 2023 │
│ ┆ ┆ d'irradiation … ┆ ┆ ┆ ┆ ┆ ┆ │
│ 9639 ┆ 28Z11Z ┆ Techniques ┆ 0 ┆ … ┆ 0.0 ┆ 01/03/2023 ┆ 2023 ┆ 2023 │
│ ┆ ┆ spéciales ┆ ┆ ┆ ┆ ┆ ┆ │
│ ┆ ┆ d'irradiati… ┆ ┆ ┆ ┆ ┆ ┆ │
└───────┴────────────┴────────────┴────────────┴───┴────────────┴───────────┴───────────┴──────────-┘
rp.get_liste('chip')
{'nom': ['Chimiothérapie hyperthermique intra-péritonéale (CHIP)'],
'abrege': ['chip'],
'thematique': ['Recours Exceptionnel'],
'actes': ['HPLB003'],
'date_saisie': ['2017-04-23T22:00:00Z'],
'auteur': ['DGOS - ATIH'],
'timestamp': [1493282250]}
rp.get_liste('cathe_cardiaque_interv_pediatrique_cardiopathie_congenitales')
{'nom': ['Cathétérisme cardiaque interventionnel pédiatrique pour cardiopathies congénitales'],
'abrege': ['cathe_cardiaque_interv_pediatrique_cardiopathie_congenitales'],
'thematique': ['Recours Exceptionnel'],
'agemax': [15],
'diags': ['Q20', 'Q21', 'Q22', 'Q23', 'Q24', 'Q25', 'Q26'],
'positions_diags': ['toutes'],
'actes': ['DAAF001',
'DAAF002',
'DAGF001',
'DAHF001',
'DAMF001',
'DASF003',
'DBAF001',
'DBAF002',
'DBAF003',
'DBAF004',
'DBAF005',
'DBLF009',
'DGAF001',
'DGAF003',
'DGAF004',
'DGAF006',
'DGAF007',
'DGLF003',
'EZGF001'],
'date_saisie': ['2017-04-23T22:00:00Z'],
'commentaire': ["Catégories d'âge suivantes : { [0 - 28 jours] ; [29 jours ; 1 an[ ; [1 an ; 5 ans] ; [6 ans ; 15 ans ] }"],
'auteur': ['DGOS - ATIH'],
'timestamp': [1493282163]}