change in pics and publish.yml

.github/workflows/publish.yml

@@ -8,6 +8,8 @@ name: Quarto Publish
 jobs:
   build-deploy:
     runs-on: ubuntu-latest
+    permissions:
+      contents: write
 
     steps:
       - name: Check out repository
@@ -34,7 +36,7 @@ jobs:
              any::rmarkdown
              any::ggplot2
 
-      - name: Publish to GitHub Pages (and render)
+      - name: Render and Publish
         uses: quarto-dev/quarto-actions/publish@v2
         with:
           target: gh-pages

0-introduktion.qmd

@@ -1,6 +1,6 @@
 # Introduktion {#sec-introduktion .unnumbered}
 
-Denne hjemmeside har til formål at klæde personale på som indsamler data i LIVING forskningsprojektet. Nogle procedure kan opdateres undervejs, hvis løbende kommer på bedre metoder. Alle ændringer vil ske på denne hjemmeside, hvorfor det er vigtigt at man orienterer sig på denne hjemmeside inden der skal foretages dataindsamling.
+Denne hjemmeside har til formål at klæde personale på som indsamler data i LIVING forskningsprojektet. Nogle procedure kan opdateres undervejs, hvis vi løbende kommer på bedre metoder. Alle ændringer vil ske på denne hjemmeside, hvorfor det er vigtigt at man orienterer sig på denne hjemmeside inden der skal foretages dataindsamling.
 
 For at sikre høj kvalitet i forskningsprojektet LIVING er det afgørende, at dataindsamlingen følger faste procedurer. Dette bidrager til ensartet indsamling af data, uanset hvilken medarbejder der foretager målinger og tests. Ud over at levere pålidelige data til forskningsprojektet, har manualen også til formål at sikre, at borgerne har en positiv oplevelse af at deltage. Inden borgerne undersøges, skal de underskrive en samtykkeerklæring, der giver Steno Diabetes Center Aarhus til at anvende resultaterne til forskningsformål.
 

2-testmanual.qmd

@@ -153,7 +153,7 @@ Er hofteomfang større end målebånd noteres dette i bemærkningsfeltet i REDca
 
 ### Billede af hoftemål
 
-[![](hofte.png)](https://github.com/Jonasmunkjensen/LIVING/blob/main/pics/hofte.PNG)
+![](pics/hofte.PNG)
 
 ## Taljemål
 
@@ -196,7 +196,7 @@ Er taljemålet større end målebånd noteres dette i bemærkningsfeltet i REDca
 
 ### Billede af taljemål
 
-[![](talje.png)](https://github.com/Jonasmunkjensen/LIVING/blob/main/pics/talje.PNG)
+![](pics/talje.PNG)
 
 ## Bioempedans
 
@@ -268,7 +268,9 @@ Formålet med rejse-sætte-sig-testen er at vurdere muskelstyrken og muskeludhol
 -   Før selve testen skal deltageren øve 1-2 oprejsninger for at sikre den korrekte teknik.
 -   Der gives ikke personstøtte.
 
-### Instruks til testpersonen (*i kursiv*)
+### Instruks til testpersonen 
+
+Instruks er beskrevet *i kursiv*
 
 *Vi skal finde ud af, hvor stærk du er i dine ben, ved at se, hvor mange gange du kan rejse dig fra en stol og sætte dig på 30 sekunder. Jeg viser dig lige, hvordan testen skal udføres.*
 
@@ -420,4 +422,4 @@ At sikre præcis måling af fysisk aktivitet.
 
 ### Billede af aktivitetsmåling
 
-\[![OBS! på billedet er den øverste film ikke taget af, for at gøre tapen tydeligt på billedet](acc.PNG)\]https://github.com/Jonasmunkjensen/LIVING/blob/main/pics/acc.PNG
+![OBS! på billedet er den øverste film ikke taget af, for at gøre tapen tydeligt på billedet](/pics/acc.PNG)

3-REDCap.qmd

@@ -10,76 +10,76 @@ Når man er tilføjet som REDCap-bruger og tildelt rettigheder i LIVING database
 
 Scroll ned i bunden af siden og login med de brugeroplysninger du har modtaget på mail
 
-[![](redc2.png)](https://github.com/Jonasmunkjensen/LIVING/blob/main/pics/redc2.PNG)
+![](pics/redc2.PNG)
 
 Når du er logget ind vælger du fanen `My Projects` i topmenuen, scroller ned i bunden af siden og vælger `LIVING`i **My Projects**
 
-[![](redc3.png)](https://github.com/Jonasmunkjensen/LIVING/blob/main/pics/redc3.PNG)
+![](pics/redc3.PNG)
 
 Du finder alt du skal bruge i menuen til venstre. Menuen er sammensat så den kun indeholder funktioner som du skal bruge.
 
-[![](redc4.png)](https://github.com/Jonasmunkjensen/LIVING/blob/main/pics/redc4.PNG)
+![](redc4.PNG)
 
 ## Oprettelse og indtastning af deltager i REDCap
 
-[![](redc5.png)](https://github.com/Jonasmunkjensen/LIVING/blob/main/pics/redc5.PNG)
+![](pics/redc5.PNG)
 
 Opret en ny borger ved at trykke på `+Add ned record`. Dette kan gøres inden den afklarende samtale
 
-[![](redc6.png)](https://github.com/Jonasmunkjensen/LIVING/blob/main/pics/redc6.PNG)
+![](pics/redc6.PNG)
 
 Tryk på cirklen for `1. besøg`
 
-[![](redc7.png)](https://github.com/Jonasmunkjensen/LIVING/blob/main/pics/redc7.PNG)
+![](pics/redc7.PNG)
 
 ## Indtastning
 
 Du kan indtaste data på borgeren inden den afklarende samtale Du kan altid gemme og vende tilbage til indtastningen ved at trykke `Save & Exit Form`
 
-[![](redc8.png)](https://github.com/Jonasmunkjensen/LIVING/blob/main/pics/redc8.PNG)
+![](pics/redc8.PNG)
 
 ::: callout-warning
 Se bort fra feltet `Uploadfelt til samtykke`. Gem det skriftlige samtykke i en mappe
 
 **!** Randomisering SKAL først ske, når skriftligt samtykke er indhentet
 :::
 
-[![](redc14.png)](https://github.com/Jonasmunkjensen/LIVING/blob/main/pics/redc14.PNG)
+![](pics/redc14.PNG)
 
 Informer borgeren om hvilken gruppe de er kommet i. I dette tilfælde **intervention**
 
-[![](redc9.png)](https://github.com/Jonasmunkjensen/LIVING/blob/main/pics/redc9.PNG)
+![](pics/redc9.PNG)
 
 ## Send spørgeskema til borger
 
 Marker hele linket `Unikt link til Questionnaire` ved at trykke `(Ctrl + a)`, kopier det `(Ctrl + c)` og send link til borger til e-boks via fx dok2 mail
 
-[![](redc15.png)](https://github.com/Jonasmunkjensen/LIVING/blob/main/pics/redc15.PNG)
+![](pics/redc15.PNG)
 
 ## Søg en borger frem
 
 I `Search query`kan du søge en borger frem vha. CPR eller navn
 
-[![](redc10.png)](https://github.com/Jonasmunkjensen/LIVING/blob/main/pics/redc10.PNG)
+![](pics/redc10.PNG)
 
 ## Vælg indtastningsark
 
 ::: callout-warning
 Når du søger en borger frem åbner den altid i 1. besøg. Tryk på `Record ID` for at få overblik over alle besøg
 :::
 
-[![](redc11.png)](https://github.com/Jonasmunkjensen/LIVING/blob/main/pics/redc11.PNG)
+![](pics/redc11.PNG)
 
 ## Vælg det relevante besøg eller spørgeskema, hvor der skal tilføjes data
 
 `Farverne` indikerer status for ark. Status ændres i bunden af hvert ark
 
-[![](redc12.png)](https://github.com/Jonasmunkjensen/LIVING/blob/main/pics/redc12.PNG)
+![](pics/redc12.PNG)
 
 ## Afslutte registrering på besøg
 
 I bunden af hvert ark kan vælges status og `Save & Exit Form` eller `Save & Go To Next Form` (dropdown menu)
 
 Når al data er udfyldt ændres `Form Status` fra **Incomplete** til **Complete** i dropdown menuen
 
-[![](redc13.png)](https://github.com/Jonasmunkjensen/LIVING/blob/main/pics/redc13.PNG)
+![](pics/redc13.PNG)

4-opsætning-af-aktivitetsmåler.qmd

@@ -24,7 +24,7 @@ Accelerometrene indstilles til én person ad gangen.
 
 -   Tryk ”Record” for at opsætte accelerometeret (du får følgende vindue frem)
 
-[![](omgui.png)](https://github.com/Jonasmunkjensen/LIVING/blob/main/pics/omgui.PNG)
+![](pics/omgui.PNG)
 
 -   Indtast borgerens RedCap/Record ID i Recording sessions
 
@@ -44,15 +44,15 @@ Accelerometrene indstilles til én person ad gangen.
 
 -   Find borgeren i REDCap og klik på det besøg der er tale om
 
-[![](redc1.png)](https://github.com/Jonasmunkjensen/LIVING/blob/main/pics/redc1.PNG)
+![](pics/redc1.PNG)
 
 -   Scroll ned til punkterne omkring accelerometer. Her indtastes Accelerometer ID nummer, det nummer der står printet på accelerometeret `fx 18 – 79290`
 
 -   TJEK igen at det indtastede accelerometer ID nummer i REDCap passer med det der er på accelerometeret.
 
 -   Hvis dataindsmalingen er færdig ændres `Form Status` fra *Incomplete* til *Complete*. Hvis der mangler at udføres målinger trykkes `Save & Exit Form`.
 
-[![](acc1.png)](https://github.com/Jonasmunkjensen/LIVING/blob/main/pics/acc1.PNG)
+![](pics/acc1.PNG)
 
 -   Udlever kuvert til borger med tape og guide til påsætning, skulle accelerometeret falde af i løbet af de 7 dage.
 

5-HbA1c-apparat.qmd

@@ -6,7 +6,7 @@
 
 -   Optisk kontrol tager et øjeblik, og bør måles hver dag instrumentet skal anvendes til tests.
 
-[![](ok1.png)](https://github.com/Jonasmunkjensen/LIVING/blob/main/pics/ok1.PNG)
+![](pics/ok1.PNG)
 
 ### Opbevaring
 
@@ -74,95 +74,95 @@ Inden udførelse af kontrol skal man sikre at apparatet angiver den rigtige enhe
 
 **D)** 2 HbA1c-kassetter
 
-[![](qc1.png)](https://github.com/Jonasmunkjensen/LIVING/blob/main/pics/qc1.PNG)
+![](pics/qc1.PNG)
 
 2.  Tænd for instrumentet
 
-[![](qc2.png)](https://github.com/Jonasmunkjensen/LIVING/blob/main/pics/qc2.PNG)
+![](pics/qc2.PNG)
 
 3.  Vælg `Kontroltest`, og vælg derefter `QC-måling`
 
-[![](qc3.png)](https://github.com/Jonasmunkjensen/LIVING/blob/main/pics/qc3.PNG)
+![](pics/qc3.PNG)
 
 4.  Vælg `Nyt QC Lot`
 
-[![](qc4.png)](https://github.com/Jonasmunkjensen/LIVING/blob/main/pics/qc4.PNG)
+![](pics/qc4.PNG)
 
 5.  Tag Info disc frem
 
-[![](qc5.png)](https://github.com/Jonasmunkjensen/LIVING/blob/main/pics/qc5.PNG)
+![](pics/qc5.PNG)
 
 6.  For at åbne låget skal du vælge `Åbn` på skærmen og følge vejledningerne på skærmen
 
-[![](qc6.png)](https://github.com/Jonasmunkjensen/LIVING/blob/main/pics/qc6.PNG)
+![](pics/qc6.PNG)
 
 7.  Anbring QC Info disc på drejeskiven inden for den hvide cirkel
 
-[![](qc7.png)](https://github.com/Jonasmunkjensen/LIVING/blob/main/pics/qc7.PNG)
+![](pics/qc7.PNG)
 
 8.  Luk låget
 
-[![](qc8.png)](https://github.com/Jonasmunkjensen/LIVING/blob/main/pics/qc8.PNG)
+![](pics/qc8.PNG)
 
 9.  Målværdierne og målområderne for *niveau 1* og *niveau 2* vises. Vælg `flueben` for at validere værdierne. QC-oplysningerne gemmes automatisk i systemet
 
-[![](qc9.png)](https://github.com/Jonasmunkjensen/LIVING/blob/main/pics/qc9.PNG)
+![](pics/qc9.PNG)
 
 10. Vælg niveauet for QC-målingen (*Niveau 1* eller *Niveau 2*)
 
-[![](qc10.png)](https://github.com/Jonasmunkjensen/LIVING/blob/main/pics/qc10.PNG)
+![](pics/qc10.PNG)
 
 11. Åbn posen med kassetten, og tag HbA1c-kassetten ud
 
-[![](qc11.png)](https://github.com/Jonasmunkjensen/LIVING/blob/main/pics/qc11.PNG)
+![](pics/qc11.PNG)
 
 12. Læg kassetten på bagsiden, og åbn den helt
 
-[![](qc12.png)](https://github.com/Jonasmunkjensen/LIVING/blob/main/pics/qc12.PNG)
+![](pics/qc12.PNG)
 
 13. Påfør forsigtigt en dråbe QC-opløsning på sugepunktet. Kontrollér, at det er på det niveau, som du netop har valgt
 
-[![](qc13.png)](https://github.com/Jonasmunkjensen/LIVING/blob/main/pics/qc13.PNG)
+![](pics/qc13.PNG)
 
 14. Kontrollér prøvemængden: Området markeret med blå skal være helt fyldt ud med QC-opløsning
 
-[![](qc14.png)](https://github.com/Jonasmunkjensen/LIVING/blob/main/pics/qc14.PNG)
+![](pics/qc14.PNG)
 
 15. Luk det hængslede dæksel fast. Når det hængslede dæksel er lukket, kan det ikke åbnes igen
 
-[![](qc15.png)](https://github.com/Jonasmunkjensen/LIVING/blob/main/pics/qc15.PNG)
+![](pics/qc15.PNG)
 
 16. Vælg `Åbn`. Fjern HbA1c QC Info disc. Sæt HbA1c-kassetten i. Luk låget
 
-[![](qc16.png)](https://github.com/Jonasmunkjensen/LIVING/blob/main/pics/qc16.PNG)
+![](pics/qc16.PNG)
 
 17. Kontrollér, at QC-opløsningens lotnummer svarer til det lotnummer, der vises på skærmen. Vælg `flueben` for at starte målingen
 
-[![](qc17.png)](https://github.com/Jonasmunkjensen/LIVING/blob/main/pics/qc17.PNG)
+![](pics/qc17.PNG)
 
 18. Når målingen er udført, skal du vælge `flueben` for at fortsætte med QC-målingen på det andet niveau
 
-[![](qc18.png)](https://github.com/Jonasmunkjensen/LIVING/blob/main/pics/qc18.PNG)
+![](pics/qc18.PNG)
 
 19. Åbn posen med kassetten, og tag HbA1c-kassetten ud
 
-[![](qc19.png)](https://github.com/Jonasmunkjensen/LIVING/blob/main/pics/qc19.PNG)
+![](pics/qc19.PNG)
 
 20. Vælg `Åbn` på skærmen for at åbne låget. Fjern den første HbA1c-kassette, sæt derefter den anden HbA1c-kassette i, og luk låget
 
-[![](qc20.png)](https://github.com/Jonasmunkjensen/LIVING/blob/main/pics/qc20.PNG)
+![](pics/qc20.PNG)
 
 21. Kontrollér, at QC-opløsningens lotnummer svarer til det lotnummer, der vises på skærmen. Vælg `flueben` for at starte målingen
 
-[![](qc21.png)](https://github.com/Jonasmunkjensen/LIVING/blob/main/pics/qc21.PNG)
+![](pics/qc21.PNG)
 
 22. Når målingen er udført, vises resultaterne for både *niveau 1* og *niveau 2*
 
-[![](qc22.png)](https://github.com/Jonasmunkjensen/LIVING/blob/main/pics/qc22.PNG)
+![](pics/qc22.PNG)
 
 23. For at afslutte målingen skal du vælge `flueben` på skærmen og bortskaffe kassetterne på korrekt vis
 
-[![](qc23.png)](https://github.com/Jonasmunkjensen/LIVING/blob/main/pics/qc23.PNG)
+![](pics/qc23.PNG)
 
 ## Rengøring af HbA1c apparat {#sec-rengøring}