-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 0
Commit
This commit does not belong to any branch on this repository, and may belong to a fork outside of the repository.
- Loading branch information
Showing
87 changed files
with
371,745 additions
and
209 deletions.
There are no files selected for viewing
Large diffs are not rendered by default.
Oops, something went wrong.
Large diffs are not rendered by default.
Oops, something went wrong.
Large diffs are not rendered by default.
Oops, something went wrong.
Large diffs are not rendered by default.
Oops, something went wrong.
This file contains bidirectional Unicode text that may be interpreted or compiled differently than what appears below. To review, open the file in an editor that reveals hidden Unicode characters.
Learn more about bidirectional Unicode characters
Original file line number | Diff line number | Diff line change |
---|---|---|
@@ -0,0 +1,30 @@ | ||
#NEXUS | ||
|
||
[ | ||
Data from: | ||
|
||
Hayasaka, K., T. Gojobori, and S. Horai. 1988. Molecular phylogeny | ||
and evolution of primate mitochondrial DNA. Mol. Biol. Evol. | ||
5:626-644. | ||
] | ||
|
||
|
||
begin data; | ||
dimensions ntax=12 nchar=897; | ||
format datatype=dna interleave=no gap=-; | ||
matrix | ||
Tarsius_syrichta AAGTTTCATTGGAGCCACCACTCTTATATTTGCCCATGGCCTCACCTCCTCCCTATTATTTTGCCTACCAAATACAAACTACGAACGAGTCCACAGTCGAACAATACCACTACCCCGTGGCCTTCAAACCCTATTACCTCTTGCAGCAACATGCTGCCTCCTCGCCAGCTTATCCAACCTGGCCCTTCCCCCAACAATTATTTTATTCGGTGCACTGTCCGTATTATTACCAGCATTTTCATGGTCACACCTATCTATTATCTTACTACGCCTTATCACCCTTATCACCGCCCTATATTCCCTATATATACTATTCATATCTCAACGAGGAAAATACACATATCATATCAACAATATCATGCCCCCTTTCACCCGAGAAAATACATTATTATTCATACACCTATTTCCCTTATTCCTACTATCTACCAACCCCAAAGTATTTATACGAACCATGTACTGTATATATACTTTATACAAAACATTACATTGTGCGTCTATTATTACAAGCCCAAAGATTTCTTATTTACCAAGAAAGTA-TGCAAGAACTGCTATCTCATGCCTCCATATATATCAATGTGGCTTTCTT-ACTTTTATACGATACAAGTATTCCATCGGTCTTACGAACCGAAAA-ATTGGTGCAACTCCAAATATATGTATTATATTTATTTTCATCCTCCATTTTACTATCACTTACACTCTTATTTACCCCATTTATTATTACAACAACTATATAATATGCAACACATGCATACCCTTACTACGTATATAACTCTATCGCCTGCGCATTTATATCAAGCCTACTCCCAATGCTCATATTTCTATACACAAATCAAGAAATATTCATTTCCAACTGCCATTGCATATCGATTCATACTATCAAATTATGCCTATGCT | ||
Lemur_catta AAGCTTCATACGAGCAACCATTCTATTATTCGCACATGGCCTTACATCATCCATATTATTCTGTCTACCCAACTCTATCTACGAACGAATCCATACCCGTACAATACTACTACCACGAGGGATCCAAACCATTCTCCCTCTTATACCCACCTGCTGCCTACTCGCCAGCCTATCTATCCTACCCCTACCCACCTCTATCAATTTATTTGGCGAACTATTCGTCACTATACCATCCTTCTCATGCTCAAACATTACAATTATCTTATTACGCTTATATATGCTCATCACCGCTCTCTATTCCCTCTATATATTATCTACTACACAACGAGGAAAACTCACATATCATTCGCACAACCTATACCCATCCTTTACACGAGAAAACACCCTTATATCCATACACATACTCCCCCTTCTCCTATTTACCTTATACCCCAAAATTATTCTACGACCCACGTACTGTATATATACTTTATA-AAAACACTACATTGTGCATCCAGAAATACAAGCTCAAAC-CTTCTTATTTACCGAGAAAGTATTGTATGCACTGCTATCTCTGCACTCCGTATATATATATACGGCTATCTCAACTTTTATACGATACAAGTATTCCATTGGCCTTACGAGCCAAAAA-ATTGGTGCAACTCCAAATATATGTATTATATCTATTATCCTCTTTCACCCTTGTCACACTGCTTATCCTATCTTTACCTATCATTATATACGTTACAAACATATACAAAAACTACCCCTATGCACCATACGTATATTCTTCTATTGCATGTGCCTTCATCACTACCCTCATCCCAACTATATTATTTATCTCCTCAGGACAAGAAACAATCATTTCCAACTGCCATTGCATATCAATCCAAACCCTATATCTATCTATTACCT | ||
Homo_sapiens AAGCTTCACCGGCGCAGTCATTCTCATATTCGCCCACGGGCTTACATCCTCATTACTATTCTGCCTACCAAACTCAAACTACGAACGCACTCACAGTCGCATCATATTCCTCTCTCAAGGACTTCAAACTCTACTCCCACTATTACCTTTTTGCTGCCTTCTACCAAGCCTCGCTATCCTCGCCTTACCCCCCACTATTATCCTACTGGGAGAACTCTCTGTGCTACTATCCACGTTCTCCTGCTCAAATATCACTCTCCTACTTACAGGACTCAACATACTACTCACAGCCCTATACTCCCTCTACATATTTACCACAACACAATGGGGCTCACTCACCCACCACATTATCAACATATATCCCTCATTCACACGAGAAAACACCCTCATGTTCATACACCTATCCCCCATTCTCCTCCTATCCCTCAACCCCGACATCATTACCGGGTTTTCCTCTTGTATATATACTTTATCCAAAACATCAGATTGTGCATCTGCCAACAGAGGCTTA-CGACCCCTTATTTACCGAGAAAGCT-CACAAGAACTGCTATCTCATGCCCCCATGTCTATCAACATGGCTTTCTCAACTTTTATACGATATCAGCTATCCATTGGTCTTACGCCCCAAAAATTTTGGTGCAACTCCAAATATATGTATTATCCATGCACACTACTATATCCACCCTATCCCTGCCTTCCCTATTTCCCCCCATCCTTACCACCCTCGTTATCCCTATCAAAAAAAACTCATACCCCCATTATGTATATTCCATTGTCGCATCCACCTTTATTATCAGTCTCTTCCCCACAACAATATTCATGTGCCTACACCAAGAAGTTATTATCTCGAACTGCCACTGCGCCACAACCCAAACAACCCAGCTCTCCCTATGCT | ||
Pan AAGCTTCACCGGCGCAATTATCCTCATATTCGCCCACGGACTTACATCCTCATTATTATTCTGCCTACCAAACTCAAATTATGCACGCACCCACAGTCGCATCATATTTCTCTCCCAAGGACTTCAAACTCTACTCCCACTATTACCCTTTTGCTGCCTCCTACCAAGCCTCGCTATCCTCGCCCTACCCCCTACCATTATTCTCCTACGGGAACTCTCCGTGCTACTATCCTCATTCTCCTGCTCAAATACCACTCTCCTACTCACAGGATTCAACATACTATTCACAGCCCTGTACTCCCTCTACATGTTTACCACAACACAATGCGGCTCACTCACCCACCACATTATTATCATATACCCCTCATTCACACGAGAAAATACTCTCATATTTTTACACCTATCCCCCATCCTCCTTCTATCCCTCAATCCTGCTATCATCACTGGATTCACCTCCTGTATATATACTTTATCCAAAACATCAGATTGTGCATCTGCCAACAGAGGCTCA-CGACCCCTTATTTACCGAGAAAGCT-TATATGCACTGCTATTTCATATCCCCATGCCTGCCAACATGGCTTTCTCAACTTTTATACGATATCAGCCATCCGTTGGTCTTACGCCCCAAAAATTTTGGTGCAACTCCAAATATATGTATTATCCATGTATACTACCATATCCACCTTATCCCTATCTCCCTTATTTCTCCCCATCCTCACCACCCTCATTATCCCTATCAAAAAAAACTCATATCCCCATTATGTGCAATCCATTATCGCGTCCACCTTTATCATTACCCTTTTCCCCACAACAATATTCATATGCCTACACCAAGAAGCTATTATCTCAAACTGGCACTGCGCAACAACCCAAACAACCCAGCTCTCCCTATGCT | ||
Gorilla AAGCTTCACCGGCGCAGTTGTTCTTATATTTGCCCACGGACTTACATCATCATTATTATTCTGCCTACCAAACTCAAACTACGAACGAACCCACAGCCGCATCATATTTCTCTCTCAAGGACTCCAAACCCTACTCCCACTATTACCCCTTTGCTGCCTTCTGGCAAGCCTCGCCAACCTCGCCTTACCCCCCACCATTATCCTACTACGAGAGCTCTCCGTACTACTATCCACATTCTCCTGCTCAAACACCACCCTTTTACTTACAGGATCTATCATACTATTTACAGCCCTGTACTCCCTTTATATATTTACCACAACACAATGCGGCCCACTCACACACCACATCACCAACATATATCCCTCATTTACACGAGAAAACATCCTCATATTCATGCACCTATCCCCCATCCTCCTCCTATCCCTCAACCCCGATATTATCACCGGGTTCACCTCCTGTATATATACTTTATCCAAAACATCAGATTGTGCATCTGCTATCAGAGGCTCA-CAACCCCTTATTTACCGAGAAAGCT-CGTATGCGCTGCTATCTCATACCCCCGTGCTTGCCAACATGGCTTTCTCAACTTTTATACGATATCAGCTATCCATTGGTCTTACGACCCAAAAATTTTGGTGCAACTCCAAATATATGTATTATCTATGTACGCTACCATATCCACCTTACCCCTATCTTCCTTATTTCCCCCTATCCTTACCACCTTCATCAATCCTATCAAAAAAAGCTCATACCCCCATTACGTATATTCTATCGTCGCATCCACCTTTATCATCAGCCTCTTCCCCACAACAATATTTCTATGCCTACACCAAGAAGCTATTATCTCAAGCTGCCACTGCGCAACAACCCAAACAATTCAACTCTCCCTATGCT | ||
Pongo AAGCTTCACCGGCGCAACCACCCTCATGCTTGCCCATGGACTCACATCCTCCCTACTGTTCTGCCTACCAAACTCAAACTACGAACGAACCCACAGCCGCATCATATTCCTCTCTCAAGGCCTTCAAACTCTACTCCCCCTATTACCCCTCTGCTGCCTTCTACCAAGCCTCACTATCCTTGCCCTACCACCCACCATCAACCTTCTACGAGAACTCTCCGTACTATTACCCATATTCTCTTGCTCTATCATCACCATCCTACTATCAGGACTCAACATACTATTCACAACCCTATACTCTCTCTATATATTCACCACAACACAACGAGGTACACCCACACACCACATCAACAACATATATCCTTCTTTCACACGCGAAAATACCCTCATGCTCATACACCTATCCCCCATCCTCCTCTTATCCCTCAACCCCAGCATCATCGCTGGGTTCGCCTACTGTATATATACTTTATCCAAAACATTACATTGTGCATCTATTATTACGGCCCCA-CAACCCCTTATTTACCGAGAAAGCT-CACAAGAACTGCTATCTCTCACT-CCATGTGTGCCAACATGGCTTTCTCAGCTTTTATACGATATCAGCTATCCCTTGGTCTTACGATCCAAAAATTTTGGTGCAACTCCAAATATATGTATCAGCCATGTTTACCACCATATCTGCCCTCACCTTATCTTCCCTATTCCCCCCCATTACCGCTACCCTCATTATCCCCAACAAAAAAAACCCATACCCCCACTATGTATATACGGCCATCGCATCCGCCTTTACTATCAGCCTTATCCCAACAACAATATTTATCTGCCTACGACAAGAAACCATCGTCACAAACTGCTGCTGCACAACCACCCAGACACTACAACTCTCACTATGCT | ||
Hylobates AAGCTTTACAGGTGCAACCGTCCTCATATTCGCCCACGGACTATCCTCTTCCCTGCTATTCTGCCTTGCAAACTCAAACTACGAACGAACTCACAGCCGCATCATATTCCTATCTCGAGGGCTCCAAGCCTTACTCCCACTGCTACCCTTCTGCTGCCTCGCAGCAAGCCTCGCTATCCTCGCCCTACCCCCCACTATTATCCTCCTACGTGCACTCTTCGTACTATTGGCCTCCTTCTCCTGGGCAAACACTACTATTACACTCACCGGGCTCAACGTACTATTCACGGCCCTATACTCCCTTTACATATTTATCATATCACAACGAGGCACACTTACACACCACATTATATACATATATCCCTCACTCACACGAGAAAACATATTATTACTTATGCACCTCTTCCCCCTCCTCCTCCTATCCCTCAACCCTATCATCATTACTGGCTTTACTCCCTGTATACATACTTTATTCAAAACATTACATTGTGCATCTATCAATACAGGCTCG-AAACCTCTTGCTTACCGAGAAAGCC-CACAAGAACTGCTATCTCACTATCCCATGTATGCCAACATGGCTTTCTCAACTTTTATACGATATCAGCTATCCATTGGTCTTACGACCCAAAAATTTTGGTGCAACTCCAAATATATGTATTACCAATGTACACCACCATACCCATTCTATCGCTATCCTCCCTATTTCCCCCCATTACAGCCACCCTTATTATCCCCAATATATAGAACTTATACCCGCACTACGTATATATGCCCATTGCCTCTACCTTTATATTCAGCCTATTTCCCACAATATTATTCATGTGCACAGACCAAGAAACCATTATTTCAAACTGCCACTGCACTGCAACCCAAACGCTACAACTCTCCCTATGCT | ||
Macaca_fuscata AAGCTTTTCCGGCGCAACCATCCTTATGCTCGCTCACGGACTCACCTCTTCCATATATTTCTGCCTACCCAATTCAAACTATGCACGCACTCACAACCGTACCATACTACTGTCCCGAGGACTTCAAATCCTACTTCCACTATCAGCCTTTTGCTGCTTATCAGCAAGCCTTACTATCCTTGCCCTACCCCCCACTATCAATCTACTACGTGCACTCTTTGTATTCGCAACCTCATTCTCCTGCTCCCATATCACCATTATGCTATCAGGACTTATCATATTATTTACGGCCCTCTACTCTCTCCACATATTCACTACAACACAACGAGGAACACTCACACATCACATATTCAACATATACCCCCCCTTCACACGAGAAAACACATTATTATTCATACACCTCGCTCCAATTATCCTTCTATCCCTCAACCCCAACATCATCCTGGGGTTTACCTCCTGTACATATACTTTATCTATATCACTACATTGTGCATCTATCCATACAGACTCA-CCACCTCTTATTTACCGAGAAAACT-CGCAAGGACTGCTATCCCATGTACCCGTACCTATATTTACGGTTTTCTCAACTTTTATACGATATCAGCTATCCATTGCCCTTACGAGTCAAAAACATTGGTGCAACTCCAAATATATGTATTATTCATGCACACCCCCATCATTATATCAACCCTTATCTCCCTATCTCTCCCAATTTTTGCCACCCTCATCAACCCTTACAAAAAACGTCCATACCCAGATTACGTATATACAACCGTATTATATGCTTTCATCATCAGCCTCCCCTCAACAACTTTATTCATCTTCTCAAACCAAGAAACAACCATTTGGAGCTGCCATTGCATATTGCCCCAAACACTACACCTATCGCTATGCT | ||
M_mulatta AAGCTTTTCTGGCGCAACCATCCTCATGCTTGCTCACGGACTCACCTCTTCCATATATTTCTGCCTACCCAATTCAAACTATGCACGCACTCACAACCGTACCATACTACTGTCCCGGGGACTTCAAATCCTACTTCCACTATCAGCTTTCTGCTGCTTATCAGCAAGCCTTACTATCCTTGCCCTACCCCCCACTATCAACCTACTACGTGCACTCTTTGTATTCGCGACCTCATTCTCCTGGTCCCATATCACCATTATATTATCAGGATTTATCATACTATTTACGGCCCTCTACTCCCTCCACATATTCACCACAACACAACGAGGAGCACTCACACATCACATATTCAACATATATCCCCCCTTCACACGAGAAAACATATTATTATTCATACACCTCGCTCCAATCATCCTCCTATCTCTCAACCCCAACATCATCCTGGGGTTTACTTCCTGTACATATACTTTATCTATATCATTACATTGTGCATCTATCCATACAGACTTA-CCACCTCTTATTTACCGAGAAAACT-CGCGAGGACTGCTATCCCATGTATCCGTACCTATATTTACGGTTTTCTCAACTTTTATACGATATCAGCTATCCATTGCCCTTACGAGTCAAAAATATTGGTGCAACTCCAAATATATGTATTATTCATGCACACCCCTATCATATTATCAACCCTTATCTCCCTATCTCTCCCAATTTTTGCCACCCTCATCAACCCTTACAAAAAACGTCCATACCCAGATTACGTATATACAACCGTATTATATGCTTTCATCATCAGCCTCCCCTCAACAACTTTATTCATCTTCTCAAACCAAGAAACAACCATTTGCAGCTGCCATTGCATATTATCCCAAACACTACACCTATCACTATGCT | ||
M_fascicularis AAGCTTCTCCGGCGCAACCACCCTTATATTCGCCCACGGGCTCACCTCTTCCATGTATTTCTGCTTGGCCAATTCAAACTATGCGCGCACTCATATCCGTACCATACTACTATCCCGAGGACTTCAAATTCTACTTCCATTGCCAGCCTTCTGCTGCCTCACAGCAAGCCTTACTATCCTTGCCCTACCCCCCACTATTATTCTACTACGCGAACTCTTTGTATTCACAACTTCATTTTCCTGCTCCCATATCACCATTGTGTTATCGGGCCTTATTATACTATTCACAGCCCTCTACTCTCTCCACATGTTCATTACAGTACAACGAGGAACACTCACACACCACATATTCAATATATATCCCCCCTTCACACGAGAAAACATATTATTATTCATACACCTCGCTCCAATTATCCTTCTATCTCTCAACCCCAACATCATCCTGGGGTTTACCTCCTGTATATATACTTTATCTATATCATTACATTGTGCATCTATCTATACAGGCCTA-CCACTTCTTATTTACCGAGAAAACT-CGCAAGGACTGCTATTCCATGCCTCCGTACTTATATCTACGGTTTCCTCAACTTTTATACGATATCAGCTATCCATTGCCCTTACGAGTCAAAAACATTGGTGCAACTCCAAATATATGTATTATTCATGCACACCCCCATCATATTATCAACCCTCATCTCCCTGCCCCTTCCAATTTTTGCCACCCTCACCAACCCCTATATATAACGTTCATACCCAGACTACGTATATACAACCGTATTATATGCTTTTATTACCAGTCTCCCCTCAACAACCCTATTCATCCTCTCAAACCAAGAAACAACCATTTGGAGTTGCCATTGCATATCAACCCAAACATTACACCTATCACTATGCT | ||
M_sylvanus AAGCTTCTCCGGTGCAACTATCCTTATACTTGCCCATGGACTCACCTCTTCCATATACTTCTGCTTGGCCAACTCAAACTACGAACGCACCCACAGCCGCATCATACTACTATCCCGAGGACTCCAAATCCTACTCCCACTATCAGCCTTCTGCTGCTTCACAGCAAGCCTTACTATTCTTGCTCTACCCTCCACTATTATTCTACTGGGCGAACTCTTCGTATTCGCAACCTCATTTTCCTGCTCCCACATCACCATCATACTATCAGGACTGCACATACTATTTACAGCCCTCTACTCTCTTCACATATTCACCACAACACAACGAGGAGCGCTCACACACCACATATTTATCATATATCCACCTTTCACACGAGAAAACATATTATTACTCATACACCTCGCTCCAATTATTCTTCTATCTCTTATCCCCAACATCATTCTACGATTTACTTCCTGTATATATACTTTATTTATATCATTACACTGTGCATCTATCTATACAAGCTTA-CCACTTCTTATTTACCGAGAAAACT-TGCAAGGACCGCTATTCCACACCTCCGTACTTATATCTACGGTTTTCTCAACTTTTATACGATATCAGCTATCCATTGGCCTTACGAGTCAAAAATATTGGTGCAACTCCAAATATATGTATTATTCATGTATACCCCCATCATATTATCAACTCTCATCTCCCTATCTCTTCCAATTTTCGCTACCCTTATCAACCCCAACAAAAAACACCTATATCCAAACTACGTATATACAGCCGTATTATATGCTTTCATTACCAGCCTCTCTTCAACAACTTTATATATATTCTTATACCAAGAAACAATCATCTGCAGCTGGCACTGCATATTATCCCAAACACTATGCCTATCATTATGCT | ||
Saimiri_sciureus AAGCTTCACCGGCGCAATGCTCCTATTATTCGCTCACGGGTTTACTTCGTCTATGCTATTCTGCCTACCAAACTCAAATTACGAACGAATTCACAGCCGAACAATATCATTTACTCGAGGGCTCCAAACACTATTCCCGCTTATACGCCTCTGCTGCCTCCTACCAAATCTCGCTATCCTCGCCCTACCCACAGCTATTATTCTACTACGAGAATTACTCACAATCGTATCTTCCTTCTCTTGCTCCAACTTTACTATTATATTCACAGGACTTATTATACTATTTACAGCACTCTACTCACTTCATATGTATGCCTCTACACAGCGAGGTCCACTTACATACAGCACCAGCAATATATATCCAATATTTACACGAGAAAATACGCTATTATTTATACATATATCACCAATCCTCCTCCTTACCTTGCGCCCCAAGGTATTTATACGACCCTCACCTTGTATTTATACTTTACCTATATCATTACATTGTGCATCTATTATTACAAGAATA-TATCTTCTTATTTACCGAGAAAGTG-CGCAAGAACTGCTATTTCATGCTCCCAAGACTATCAACTTGGCTTCCTCAACTTTTATACGATACTACTTATCCATTGGTCTTACGAGCCAAAAACATTGGTGCAACTCCAAATATATGTATTA---ATACACTTCTCCATCACTCTATTATCACTATTTACCCTACTACCGCCAATCCTACCTACCCTCATTATCCCTATCAAAAGCACACTATACCCGTACTACGTATATCTACCCATCATCTACGCCCTCATTACCAGTACCTTATCTATATTATTCTTTATCCTTACAGGCCAAGAATCAATATTTTCAAACTGCCACTGCATATCTATCCAAACCATCAAACTATCCCTATGCT | ||
; | ||
end; | ||
|
Oops, something went wrong.