taxonomie en Venn dia gecorrigeerd vr aantal reads per staal

[slambrechts]

taxonomie plots en Venn diagrammen op basis van data gecorrigeerd voor aantal reads per staal, anders is denk ik bijvoorbeeld gedeelde en unieke OTUs per landgebruik, taxonomie, etc niet vergelijkbaar

[hansvancalster]

Dus nu even in je terminal venster zorgen dat branch update_data_analyse actief is, eventuele modified files committen of stashen, en dan git pull origin main en je hebt de functie check_presence.R ook beschikbaar in deze branch.

[slambrechts]

ik heb GBIF check presence toegevoegd, maar het werkt momenteel nog niet. Ligt het aan hoe de functie controleert of het een vector of een input file is, of ligt het aan mijn vector? Ik heb de data in vector formaat gezet, omdat ik wou voorkomen dat ik de data moet wegschrijven als txt en dan opnieuw moet inladen

[hansvancalster]

Het is een bug in de functie. Zal ik een fix pushen naar deze branch?

[slambrechts]

Ok bedankt. Moet ik dan opnieuw git pull origin main doen nadat check_presence.R aangepast is?

[hansvancalster]

Ok bedankt. Moet ik dan opnieuw git pull origin main doen nadat check_presence.R aangepast is?

Enkel git pull om de commits die ik gepushed heb lokaal binnen te krijgen

[hansvancalster]

Dan kan deze branch gemerged worden. Doe jij dat maar @slambrechts hier onderaan op de knop drukken. Lokaal kan je dan de branch main nemen en via git pull de wijzigingen binnenhalen. Daarna kan je de andere PR up to date brengen door die branch te kiezen en git pull origin main uit te voeren en de wijzigingen te pushen.

[hansvancalster]

Dan kan deze branch gemerged worden. Doe jij dat maar @slambrechts hier onderaan op de knop drukken. Lokaal kan je dan de branch main nemen en via git pull de wijzigingen binnenhalen. Daarna kan je de andere PR up to date brengen door die branch te kiezen en git pull origin main uit te voeren en de wijzigingen te pushen.

ah, je hebt daarvoor de nodige rechten niet. Ik zal het doen